Berikut merupakan daftar kerjasama antara UAJY dengan institusi di luar negeri yang masih aktif masa perjanjian kerjasamanya sampai dengan Agustus 2015
| No | Nama Instansi | Negara |
| 1. | Dili Institute of Technology | Timor Leste |
| 2. | Universiti Teknikal Melaka | Malaysia |
| 3. | University of Santo Thomas, Philippines | Filipina |
| 4. | De La Salle University | Filipina |
| 5. | Chung Yuan Christian University | Taiwan |
| 6. | Asian Institute Of Technology | Thailand |
| 7. | Princeton In Asia, Princeton University | USA |
| 8. | Highline Community College | USA |
| 9. | Murdoch University | Australia |
| 10. | Griffith University | Australia |
| 11. | University of Tasmania (UAJY sebagai anggota APTISI) | Australia |
| 12. | Macquire University | Australia |
| 14. | Rotterdam Business School at Rotterdam University, Rotterdam | Belanda |
| 15. | University Of Northampton | Inggris |
| 16. | Technische Universitat Ilmenau | Jerman |
| 17. | Passau University | Jerman |
| 18. | Universite Catholique De Lille | Perancis |
| 19. | Southern Denmark University | Denmark |
| 20. | Swansea University | United Kingdom |
| 21. | Bonn-Rhein-Sieg University of Applied Sciences | Jerman |
Universitas Atma Jaya Yogyakarta (UAJY) adalah lembaga pendidikan tinggi swasta yang didirikan oleh kaum awam Katolik dan dikelola oleh Yayasan Slamet Rijadi - Yogyakarta, di bawah lindungan Santo Albertus Magnus. Universitas Atma Jaya Yogyakarta lahir pada tanggal 27 September 1965, dengan tujuan untuk ikut serta mencerdaskan kehidupan bangsa melalui pendidikan yang berdimensi serta berorientasi global.
